数控火焰切割机的控制系统软件由C语言和汇编语言混合编程，执行了自顶而下，模块化设计的面向对象编程思想，在程序中设计了“软件陷阱”及监视狗WatchDog等程序，保证其可靠性。整个控制程序由监控程序、PID调节程序、火焰切割程序和数学运算程序4大部分组成。
系统可有4种工作方式选择，即零件编辑、系统检测、直线运动、火焰切割零件编辑子程序可以完成零件输入，零件修改以及复制、改变切割方向等功能。系统检测子程序可以实现对系统各个部件的状态检测，测试各种阀门的性能。
数控火焰切割子程序为汉字菜单引导，可以在切割前显示整个钢板的零件。在切割中动态跟踪割炬轨迹。该子程序具有火焰自动穿孔功能，整个穿孔过程是由采取两种不同压力的预热氧和切割氧的自动转换，割炬自动升高实现的。
数控等离子切割机子程序也能实现火焰切割的汉字菜单引导、零件图形动态显示等功能。该子程序具有数控等离子切割机自动穿孔功能，先由控制系统向等离子系统发出。起弧命令，等离子系统受到起弧指令其后将该指令传输给弧压初始定位系统令割炬自动下降，到达台适的起弧位置后，弧压调高系统向等离子系统发出起弧信号，数控等离子切割机系统接受到该信号后先预流气体，然后高频起弧电路工作，电极与喷嘴高频放电将气体离子化，产生引导弧。引导弧接触到钢板后形成切割弧将钢板击穿，等离子系统检测到这一状态后，高频起弧电路停止工作，同时控制系统受到数控等离子切割机系统反馈的“运动信号，切割机开始运动，切割开始，同时弧压自动调高开始工作。该自动调高系统是根据如下原理进行工作的；当电极与钢板之间形成电弧后，在电极与钢板之间有弧压产生。弧压在匀逮运动时与电极到钢板之间的距离成正比，当炬离铜板距离远时，弧压增高，反之弧压降低。我们设定一定的弧压值，采样实际的弧压与之比较，如果采样值大于设定值则令割炬下降，反之令割炬上升。
数控等离子切割机具有效率高、质量好、费用低等优势，数控火焰切割机的等离子化改造是提高数控机床生产效率和质量的有效途径。目前，在我国各生产企业使用的数百台数控切割机中，具有等离子切剖系统的不足。在系统改造任务中，由于配备的等离子系统差异较大，从简单切割到大型水下切割及精细切割，设备规格10余种，这就要求数控系统有良好的适应性。
